医学系有临床医学专业和中医学二个专业，其中临床医学专业连续5年招收订单生，为广西示范特色专业。医学系现有1个大师工作室（李超乾工作室），内、外、妇、儿、预防医学、心理学五官/急救等7个教研室和2个校医务室。医学系教师46人，其中专任教师35人。正教授3人，副教授/副主任医师9人，讲师和主治医师12人；研究生23人；有20位教师具有“双师”资格。

近五年教学团队主持省级课题1项，厅级课题8项，校级课题4项；教师发表论文44篇，其中核心期刊11篇，广西优秀期刊20篇；编写教材6本，其中担任主编4人次，副主编6人次；获得广西适宜技术推广奖二等奖1项，全国卫生行指委教学成果奖二等奖1项,全国职业院校信息化教学大赛三等奖1项，广西职业院校信息化教学大赛一等奖1项，二等奖2项，三等奖1项。

医学系职业技能考评组能开展养生推拿、小儿推拿和保健调理师等职业技能鉴定工作。

医学系在校生约1500人，已成为为广西基层医疗卫生机构培养“下得去、用得上、留得住”的临床医学专门人才的摇篮，2018年就业率达100%。历届毕业生基础理论扎实、临床技能过硬，深受各级医疗单位的欢迎。